Responsabilidade Social

Identificação e caracterização In Silico de genes da família WRKY em Phaseolus Vulgaris

Inovação Tecnológica

Unidade: Umuarama

Titulação: Doutorado - Atividade: Pesquisa Institucional

Cod. CNPQ: 000500000 – Ciências Agrárias

Núcleo de Pesquisa: Ciências Biológicas, Agrárias e Tecnológicas

Linha de Pesquisa: Biotecnologia aplicada ao melhoramento vegetal

Professora: Silvia Graciele Hulse de Souza

Resumo: Os fatores de transcrição da família WRKY desempenham papéis importantes nas respostas a vários estresses biótico e abiótico em plantas, assim como são componentes essenciais na regulação da expressão do gene. Dessa forma, o objetivo deste trabalho será caracterizar e identificar “in silico” os fatores de transcrição WRKY presentes no Banco de dados ESTs de Phaseolus vulgaris e avaliar a modulação transcricional de genes em resposta ao estresse biótico e abiótico. Serão identificados os possíveis genes WRKY de feijão através de pesquisas no Banco de dados Genoma de Feijão de Phaseolus vulgaris.

Após será feita a análise filogenética usando o algorítimo ClustalW e a árvore será construída com a ajuda o programa Mega. A identificação dos motivos conservados fora do domínio conservado WRKY serão realizadas nas sequências protéicas de P. vulgaris usando o algoritmo ClustalW e MEME Suíte. Para identificação da posição do íntron será utilizada a ferramenta de bioinformática Gene Structure Display Server. As sequencias proteícas WRKY serão analisadas quanto a sua  localização subcelular utilizando os algoritmos LOCTREE3 e WoLF PSORT. Serão também feitas anotação de genes WRKY no cromossomo de P. vulgaris. As informações geradas nesse estudo servirão como subsídios para a seleção de genes candidatos para futuras análises funcionais da família WRKY em P. vulgaris, dos quais ajudarão na compreensão dos determinantes genéticos da tolerância ao estresse biótico e abiótico em plantas.

Identificação e caracterização In Silico de genes da família WRKY em Phaseolus Vulgaris